Bioinformatics Unit, Division of Infectious Sicknesses, Nationwide Institute of Well being Doutor Ricardo Jorge (INSA), Lisbon, Portugal
Vítor Borges, Joana Isidro & João Paulo Gomes
Department of Global Epidemiology and Inhabitants Research, Fogarty Global Heart, Nationwide Institutes of Well being, Bethesda, MD, USA
Nídia Sequeira Trovão
Innovation and Generation Unit, Division of Human Genetics, Nationwide Institute of Well being Doutor Ricardo Jorge (INSA), Lisbon, Portugal
Sílvia Duarte, Hugo Martiniano & Luís Vieira
Reference and Surveillance Unit, Division of Infectious Sicknesses, Nationwide Institute of Well being Doutor Ricardo Jorge (INSA), Lisbon, Portugal
Helena Cortes-Martins
Instituto Gulbenkian de Ciência (IGC), Oeiras, Portugal
Isabel Gordo, Ricardo Leite, Cathy Paulino, João Costa, João Sobral & Susana Ladeiro
Centre for Toxicogenomics and Human Well being (ToxOmics), Genetics, Oncology and Human Toxicology, Nova Scientific College; Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Nova de Lisboa, Lisbon, Portugal
Luís Vieira
Nationwide Reference Laboratory for Influenza and different Respiration Viruses, Division of Infectious Sicknesses, Nationwide Institute of Well being Doutor Ricardo Jorge (INSA), Lisbon, Portugal
Raquel Guiomar
Centro Hospitalar de Vila Nova de Gaia e Espinho, Vila Nova de Gaia, Portugal
Agostinho José S. Lira, Filomena Lacerda, Jorge Meneses, Maria Matos Figueiredo, Nair Seixas & Paulo Leandro
Laboratório Regional de Saúde Pública Drª Laura Ayres – ARS Algarve, Almancil, Portugal
Aida M. Sousa Fernandes
Serviço de Patologia Clínica, Health center de Braga, Braga, Portugal
Alexandra Estrada & Fernando Branca
Instituto Nacional de Saúde Dr Ricardo Jorge (INSA), Lisboa, Portugal
Alexandra Nunes, Ana Pelerito, Anabela Vilares, Baltazar Nunes, Carla Feliciano, Carla Roque, Célia Rodrigues Bettencourt, Constantino P. Caetano, Cristina Correia, Cristina Veríssimo, Elizabeth Pádua, Fátima Martins, Fernanda Vilarinho, Idalina Ferreira, Inês Costa, Isabel Lopes de Carvalho, Ivone Água-Doce, Jorge Machado, José Vicente Constantino, Leonor Silveira, Líbia Zé-Zé, Márcia Faria, Margarida Vaz, Maria João Gargate, Maria José Borrego, Mónica Oleastro, Nuno Verdasca, Patrícia Barros, Paula Bajanca-Lavado, Paula Palminha, Pedro Pechirra, Raquel Neves, Raquel Rocha, Raquel Rodrigues, Raquel Sabino, Rita Cordeiro, Rita de Sousa, Rita Macedo, Rita Matos, Sílvia Lopo, Sónia Silva, Susana Martins, Susana Silva & Vera Manageiro
Beatriz Godinho Saúde, Leiria, Portugal
Alfredo Rodrigues & Maria Beatriz Tomaz
Serviço de Patologia Clínica, Centro Hospitalar Tondela-Viseu, Viseu, Portugal
Ana Caldas, Isabel Albergaria & Margarida Farinha
Serviço de Microbiologia, Centro Hospitalar do Porto, Porto, Portugal
Ana Constança & Maria Helena Ramos
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Lisboa, Portugal
Ana Margarida Henriques, Miguel Fevereiro & Tiago Luís
Laboratório de Análises Clínicas da Universidade de Coimbra, Coimbra, Portugal
Ana Miguel Matos
ACES de Baixo Vouga, Administração Regional de Saúde do Centro, Aveiro, Portugal
Ana Oliveira & Regina Sá
Laboratório de Microbiologia e Biologia Molecular do Centro Hospitalar de Lisboa Ocidental, Lisboa, Portugal
Ana Paula Dias, Cristina Toscano, João Dias & Maria Ana Pessanha
Serviço Especializado de Epidemiologia e Biologia Molecular, Health center de Santo Espírito, Ilha Terceira, Açores, Angra do Heroísmo, Portugal
Ana Rita Couto & Jácome Bruges Armas
Unidade Native de Saúde de Matosinhos, Matosinhos, Portugal
António Albuquerque & Valquíria Alves
Interactive Applied sciences Institute – LARSyS, Funchal, Portugal
Bruna R. Gouveia & João Rodrigues
Centro de Investigação de Montanha, Instituto Politécnico de Bragança, Bragança, Portugal
Carina de Fátima Rodrigues & Maria Alice Pinto
Laboratório de Análises Clínicas Dr Joaquim Chaves, Lisboa, Portugal
Carlos Cardoso & Pedro Cardoso
Laboratório De Biologia Molecular da Unilabs, Porto, Portugal
Carlos Sousa
Unidade de Genética e Patologia Moleculares, Health center do Divino Espirito Santo de Ponta Delgada, Ilha de S. Miguel, Açores, Ponta Delgada, Portugal
Claudia C. Branco, Luisa Mota-Vieira & Rita C. Veloso
Centro de Estudos de Doenças Crónicas, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Nova de Lisboa, Lisboa, Portugal
Cláudia Nunes dos Santos & Paulo Pereira
Laboratório Biologia Molecular- Serviço de Patologia Clínica, Centro Hospitalar Universitário Lisboa Central, Lisboa, Portugal
Conceição Godinho, Isabel Dias, Isabel Fernandes, Lidia Santos, Lurdes Lopes, Olga Costa, Patricia Miguel, Paula Branquinho, Paula Soares, Rita Côrte-Actual & Sónia Rodrigues
ALS Controlvet, Tondela, Portugal
Daniela Silva & Inês Gomes
Centro Médico da Praça, São João da Madeira, Portugal
Diana Patrícia Pinto da Silva & Ricardo Filipe Romão Ferreira
Serviço de Patologia Clínica, Centro Hospitalar de Trás-os-Montes e Alto Douro, Vila Actual, Portugal
Eliana Costa & Sara Sousa
Serviço de Patologia Clínica, Unidade Native de Saúde da Guarda, Guarda, Portugal
Fátima Vale, Joana Ramos, Nelson Ventura, Patricia Fonseca & Rita Gralha
Health center Espírito Santo, Évora, Portugal
Filomena Caldeira
Laboratório Dra Helena Rodrigues, Valença, Portugal
Francisca Rocha & Helena Rodrigues
Serviço de Patologia Clínica – Health center Dr. Nélio Mendonça – SESARAM, Funchal, Portugal
Graça Andrade, José Alves & Ludivina Freitas
Serviço de Patologia Clínica, Health center de Vila Franca de Xira, Vila Franca de Xira, Portugal
Helena Ribeiro, Luís Silva, Rita Rodrigues & Teresa Salvado
Instituto de Administração da Saúde da Madeira, Funchal, Portugal
Herberto Jesus & Maurício Melim
Serviço de Virologia, Instituto Português de Oncologia do Porto, Porto, Portugal
Hugo Sousa & Inês Baldaque
Serviço de Patologia Clinica – Unidade Native de Saúde Litoral Alentejano, Santiago do Cacém, Portugal
Inna Slobidnyk
Existence and Well being Sciences Analysis Institute, College of Medication, College of Minho, Braga, Portugal
João Carlos Sousa & Maria Isabel Veiga
Synlab, Lisboa, Portugal
Laura Brum
Secção de Patologia Molecular, Synlab, Lisboa, Portugal
Lurdes Monteiro
Centro Hospitalar Tâmega e Sousa, Penafiel, Portugal
Maria Calle Vellés & Mariana Viana
Serviço de Imunohemoterapia, Unidade Native de Saúde do Alto Minho, Viana do Castelo, Portugal
Maria da Graça Maciel de Soveral & Miguel Babarro Jorreto
Laboratório de Imunologia e Biologia Molecular, Centro Hospitalar de Setúbal, Setúbal, Portugal
Maria João Peres
Serviço de Patologia Clínica da Unidade Native de Saúde de Castelo Branco, Castelo Branco, Portugal
Mariana Martins, Ricardo Rodrigues & Sandra Paulo
iBiMED/Universidade de Aveiro, Aveiro, Portugal
Miguel Pinheiro
Departamento de Saúde Pública e Planeamento, ARS Alentejo, Évora, Portugal
Paula Valente
Secretaria Regional de Saúde e Proteção Civil – Governo Regional da Madeira, Funchal, Portugal
Pedro Ramos
Health center Agostinho Ribeiro-Felgueiras, Felgueiras, Portugal
Sónia Marta Santos Magalhães
V.B., J.I., and J.P.G. designed the learn about. V.B. and J.I. carried out the pre-sequencing wet-lab procedures, genome meeting, curation and classification, and genetic and epidemiological information curation and integration. H.C.M. carried out metadata assortment and curation. H.M. supported information divulgation via putting in the general public website online. S.D., L.V., R.L., and I.G. carried out and/or supervised the wet-lab sequencing procedures. N.S.T. conceived and carried out the Bayesian phylodynamic analyses. N.S.T. retrieved the exterior genetic information and assembled the datasets. The consequences have been analyzed and interpreted via V.B., J.I., and N.S.T.; V.B., J.I., N.S.T., and J.P.G. wrote and reviewed the manuscript. All authors learn and authorized the general manuscript. All authors from the Portuguese community for SARS-CoV-2 genomics (Consortium) contributed to laboratory prognosis of SARS-CoV-2, pattern and knowledge assortment, and/or equipped recommendation on epidemiology and bioinformatics information research. R.G. supported pattern assortment and pre-sequencing wet-lab procedures. J.P.G. coordinated the learn about.
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